Исследователи из Университета Восточной Англии (Великобритания) определили генетические характеристики 18 ранее неизвестных видов бактерий в образцах пациентов с раком предстательной железы. При этом большая часть этих бактерий изначально принадлежала оральной микробиоте. Ранее уже звучали предположения о связи определенных бактерий полости рта с повышенным риском развития агрессивных форм рака простаты, однако до сих пор значимость этой связи оставалась неясной. Чтобы прояснить этот вопрос, ученые проанализировали 2176 наборов данных секвенирования ДНК, полученных от 194 пациентов. В результате специалистам удалось восстановить 249 бактериальных геномов, 24 из которых не соответствовали ни одному из известных ранее видов.
Для реконструкции бактериальных геномов исследователи применили метод метагеномной сборки. В качестве исходного материала они использовали последовательности ДНК, которые обычно отбрасываются при изучении генома человека, поскольку не совпадают с человеческой ДНК. Такой подход позволил идентифицировать бактерии без необходимости сбора дополнительных образцов или проведения повторного секвенирования. Кроме того, ученые спрогнозировали условия, необходимые для культивирования выявленных микроорганизмов, и разработали ДНК-тест для обнаружения одного из этих видов. Это открывает новые возможности для более точного изучения отдельных видов бактерий и определения их связи с агрессивным раком предстательной железы.
Полученные результаты могут привести к созданию новых инструментов для исследования взаимосвязи между бактериями полости рта и раком простаты. Тем не менее, данное исследование не доказывает, что бактерии напрямую влияют на развитие заболевания. Ученые считают, что необходимы дальнейшие исследования, чтобы выделить эти микроорганизмы, изучить их воздействие на организм и определить, могут ли они выступать биомаркерами или мишенями для терапии.